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 ドラフト会議で指名された選手を出身校別に記載してます。ドラフト会議で指名されずに入団した選手（いわゆるドラフト外）は記載していませんので御注意ください。ドラフト外入団選手のデータはこちら |
| 海 星 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 松尾 格 | 海星高→’72ロッテ3位 | ’71 ’72 |
| 酒井 圭一 | 海星高→’76ヤクルト1位 | ’76 |
| 平田 勝男 | 海星高→明治大→’81阪神2位 | ’76 |
| 大久保 勝也 | 海星高→’85大洋6位 | |
| 堀 幸一 | 海星高→’87ロッテ3位 | |
| 松永 浩典 | 海星高→三菱重工長崎→’05（大・社）西武希望枠 | |
| 永江 恭平 | 海星高→’11西武4位 | ’11 |
| 長崎日大 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 貝塚 政秀 | 長崎日大高→三菱重工長崎→’99西武5位 | |
| 中村 隼人 | 長崎日大高→創価大→本田技研→’00日本ハム4位 | ’93 |
| 野原 将志 | 長崎日大高→’06（高校）阪神1巡目 | |
| 宮崎 祐樹 | 長崎日大→亜細亜大→セガサミー→’10オリックス3位 | ’03 |
| 瓊 浦 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 本西 厚博 | 瓊浦高→三菱重工長崎→’85阪急4位 | ’80 |
| 下柳 剛 | 瓊浦高→八幡大中退→新日鉄君津→’90ダイエー4位 | |
| 山口 信二 | 瓊浦高→新日鉄君津→’91ダイエー5位 | |
| 佐世保実 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 吉田 直喜 | 佐世保実高→青山学院大→’89オリックス2位 | |
| 村田 善則 | 佐世保実高→’92巨人5位 | ’92 |
| 川島 慶三 | 佐世保実高→九州国際大→’05（大・社）日本ハム3巡目 | |
| 波佐見 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 石橋 尚登 | 波佐見高→’00広島6位 | |
| 大平 成一 | 波佐見高→’07（高校）日本ハム4巡目 | |
| 松田 遼馬 | 波佐見高→’11阪神5位 | |
| 島原中央 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 生田 裕之 | 島原中央高→丹羽鉦電機→あけぼの通商→’76中日2位 | |
| 藤田 宗一 | 島原中央高→西濃運輸→’97ロッテ3位 | |
| 佐世保工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 白武 佳久 | 佐世保工高→日本体育大→’82広島2位 | ’78 |
| 香田 勲男 | 佐世保工高→’83巨人2位 | ’82 ’83 |
| 長崎南山 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 松田 和哉 | 長崎南山高→’91西武4位 | |
| 藤原 紘通 | 長崎南山高→福岡大→NTT西日本→’08楽天1位 | |
| 清 峰 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 今村 猛 | 清峰高→’09広島1位 | ’08 |
| 古川 秀一 | 清峰高→日本文理大→’09オリックス1位 | ’05 |
| 五 島 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 川崎 義通 | 五島高→電電九州→’67東映9位 | |
| 長崎商 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 松尾 輝義 | 長崎商高→’69巨人10位 | ’69 |
| 猶興館 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 尾崎 亀重 | 猶興館高→国士舘大→電電東京→’71ヤクルト8位 | |
| 口 加 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 木村 広 | 口加高→日本大→’75太平洋5位 | |
| 島原農 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 柴田 保光 | 島原農高→丹羽鉦電機→あけぼの通商→’78西武2位 | |
| 宇 久 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 増本 宏 | 宇久高→九州産大→’78大洋4位 | |
| 対 馬 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 小島 善博 | 対馬高→NTT九州→’90日本ハム3位 | |
| 島原工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 林田 堅吾 | 島原工高→アリゾナウエスタン短大→’96日本ハム8位 | |
| 長崎工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 加藤 隆行 | 長崎工高→’00阪神5位 | |
| 鎮西学院 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 土田 瑞起 | 鎮西学院高→長崎セインツ→愛媛マンダリンパイレーツ→’11（育成）巨人2位 | |
| 西 陵 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 釜元 豪 | 西陵高→’11（育成）ソフトバンク1位 | |
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