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滋賀県の高校からドラフト会議で指名された選手を記載しています。ドラフト外はこちら| 近 江 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 島脇 信也 | 近江高→2001オリックス4巡目 | 2001 |
| 竹内 和也 | 近江高→2001西武5巡目 | 2001 |
| 村西 辰彦 | 近江高→愛知学院大→米マイナーリーグ→2001日本ハム8巡目 | 1996 |
| 木谷 寿巳 | 近江高→東北福祉大→王子製紙→2005（大・社）楽天6巡目 | 1998 |
| 伊奈 龍哉 | 近江高→2006（高校）ソフトバンク3巡目 | 2005 |
| 小熊 凌祐 | 近江高→2008中日6位 | 2007 2008 |
| 植田 海 | 日本航空高（退学）→近江高→2014阪神5位 | 2014 |
| 京山 将弥 | 近江高→2016DeNA4位 | 2016 |
| 土田 龍空 | 近江高→2020中日3位 | 2018 2019 |
| 北村 恵吾 | 近江高→中央大→2022ヤクルト5位 | 2016 2018 |
| 山田 陽翔 | 近江高→2022西武5位 | 2021 2022 |
| 林 優樹 | 近江高→西濃運輸→2022楽天6位 | 2018 2019 |
| 比叡山 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 間柴 富裕 | 比叡山高→1969大洋2位 | |
| 本郷 宏樹 | 比叡山高→龍谷大→1998ヤクルト4位 | |
| 村西 哲幸 | 比叡山高→1999横浜3位 | 1999 |
| 細見 直樹 | 比叡山高→1999ヤクルト4位 | 1999 |
| 岩見 雅紀 | 比叡山高→慶応大→2017楽天2位 | |
| 北大津 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 中西 健太 | 北大津高→2004ダイエー4巡目 | 2004 |
| 石川 駿 | 北大津高→明治大→JX-ENEOS→2014中日4位 | |
| 則本 佳樹 | 北大津高→近畿大→山岸ロジスターズ→2018（育成）楽天2位 | 2012 |
| 伊 香 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 西村 高司 | 伊香高→1972巨人2位 | |
| 藤高 俊彦 | 伊香高→新日鉄広畑→1981西武5位 | |
| 瀬田工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 西崎 幸広 | 瀬田工高→愛知工大→1986日本ハム1位 | |
| 平田 大樹 | 瀬田工高→2023（育成）日本ハム2位 | |
| 八幡商 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 西川 純司 | 八幡商高→三重中京大→2005（大・社）西武4巡目 | 2000 |
| 則本 昂大 | 八幡商高→三重中京大→2012楽天2位 | |
| 八日市南 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 田中 崇博 | 八日市南高→2008（育成）ロッテ8位 | |
| 東 弘明 | 八日市南高→徳島インディゴソックス→2013（育成）オリックス1位 | |
| 滋賀学園 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 宮城 滝太 | 滋賀学園高→2018（育成）DeNA1位 | |
| 鈴木 蓮 | 滋賀学園高→2022（育成）DeNA2位 | |
| 堅 田 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 都 裕次郎 | 堅田高→1976中日1位 | |
| 長浜北 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 田嶋 俊雄 | 長浜北高→日本生命→1986南海1位 | |
| 栗 東 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 柴田 博之 | 栗東高→東北福祉大→1998西武4位 | |
| 玉 川 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 松村 豊司 | 玉川高→立命館大→2003オリックス6巡目 | |
| 守 山 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 竹岡 和宏 | 守山高→近大→日本IBM野洲→中山硬式野球クラブ→米3A→2003ダイエー8巡目 | |
| 高 島 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 瀧中 瞭太 | 高島高→龍谷大→ホンダ鈴鹿→2019楽天6位 | |
| 膳 所 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 水口 創太 | 膳所高→京都大→2022（育成）ソフトバンク7位 | |
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